美国新一期植物基因组计划继续关注基因组研究与应用

作者: 2014-09-12 09:14 来源:其他
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2014年5月,美国科技政策办公室(OSTP)发布了第四个《国家植物基因组计划五年规划(2014-2018)》,继续关注植物基因组领域相关数据的开放获取、知识共享以及相关工具和数据库的开发,同时重视基因组学在农业中的应用,以加速植物育种,改进农业实践,降低对环境资源的需求及应对气候变化带来的挑战[1]。其主要目标和策略包括:

一、开发新一代植物数据库和工具,以增强创新价值链上从基础研究到实际应用到推广各环节的能力

具体策略包括,开发便于检索的一站式网络门户;改进数据可视化工具和分析工具;加强对高通量基因分型设备的使用;拓展田间表型鉴定能力;开发和利用基因组工程工具包;改进生物化学筛选工具。

二、建立一个植物种质资源网络,以满足21世纪国家研究和育种的需求

包括扩大用于基因组研究、性状分析和作物改良的新群体;有效管理遗传资源库和遗传多样性;开发新的表型和序列索引的遗传资源;加强相互关联的网络信息资源建设以促进种质资源的广泛利用。

三、开发有助于增强植物生物学研究的工具,并将所获得的知识向精准植物育种转化,以开发可持续粮食、生物能源和工业原料生产系统

包括开发从细胞到植株的植物生长发育生命周期系统视图;开发下一代表观基因组学;加强对矿物质代谢(包括氮和磷的利用效率)、代谢分区及植物微生物间互作的理解;在新开发的作物预测模型中纳入变异、生理和环境信息;开发新的高通量分型工具和方法;分析和评估不同环境中的遗传多样性;增进对基因和蛋白质功能的理解。

四、提升工作人员利用新一代工具和资源的能力

扩大对跨学科研究生培养计划的支持;为设计和投资下一代数据库系统培养新一代植物科学家和育种家;为国际植物基因组计划项目的学生提供更多国际实习的机会。

五、加强公私合作,推进基础研究向实践应用的转化并支持农业实践创新

加强公共基础研究之间的协调,并促进向公司支持的下游开发转化。

六、加强国际合作,以促进新发现能够产生普惠效应

包括开放公共基因组资源和分析工具;促进公共数据集的信息分析和标准建设;促进核心基因组注释工作及促进种质资源的国际共享。

(袁建霞 董瑜)



[1] National Plant Genome Initiative Five-Year Plan: 2014-2018.http://www.whitehouse.gov/sites/default/files/microsites/ostp/NSTC/npgi_five-year_plan_5-2014.pdf.

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