美国NSTC发布“微生物组”研究评估报告

作者: 2016-01-01 13:18 来源:战略情报研究部
放大 缩小

微生物无处不在,深入理解“微生物组”(栖息在多种多样生态系统中的微生物群落)在地球生物圈和人类健康中所起的作用,将会助力人类克服目前遇到的环境、健康和社会危机。在过去几年间,微生物组研究已经引起美国政府的高度重视。2015年2月美国国家科学技术委员会(NSTC)成立了测绘微生物组快速通道行动委员会(FTAC-MM),对美国政府资助的微生物组研究项目进行评估。2015年11月20日,NSTC发布FTAC-MM微生物组研究报告[1],公布了对过去三年间美国政府资助的微生物组研究情况进行整体调研的结果,并对未来研究发展提出了重要建议。

报告证实,美国政府在2012-2014财年共投入约9.22亿美元资助了2784个微生物组研究项目,年均投入约3.07亿美元,每年经费均有所增长。其中约59%的研究是通过国立卫生研究院资助的。FTAC-MM还发现对人类微生物组的研究资助远远高于其他研究,约占三年总经费的37%,而对农业微生物组的研究重视程度远未达到预期水平。特别是与基础微生物组研究相比较,基于食品的研究、病毒微物生物组研究、应用微生组研究和工具开发的资助额度均较低。

FTAC-MM了解到目前微生物组研究遇到的主要问题包括:(1)科学家和项目经理对分析研究所产生的海量数据分析软件需求很大;(2)生物信息学家利用计算和模型解析研究结果的能力有待提升;(3)各类微生物组研究缺乏标准,对参考材料、基准数据、微生物组和个体生物样本库的需求迫切。

因此,FTAC-MM向美国政府提出建议:(1)鼓励标准和基准工具的开发;鼓励适应性好、用户友好的综合性微生物组数据库和平台技术的开发,加深人们对微生物组的了解;(2)建立数据解析工作组,对微生物组研究产生的数据进行分析解释。

FTAC-MM建议开展合作研究、教学和培训,并指出应重点发展的微生物组研究关键技术包括:

1、规程标准和参考材料。各研究机构已经开始创建各类初始方案,例如美国内政部(DOI)开发的海洋沉积物取样方案和美国农业部(USDA)与各机构共同协作开发的食品标准等。各机构将优先合作建设生态系统相关标准。

2、包括宏基因组、代谢组、蛋白质组、脂质组、元数据和其他未知数据的适应性良好、用户友好的综合性数据库。美国政府资助的多个生态系统研究,均可以建立起相应的数据库。并且,所有这些受到政府资助的数据都应该向大众公开。

3、低成本和可用于不同规模检测的微生物组高通量工具。这些技术可以使微生物组研究更加开放,使受到较少资助的机构也能像其他机构一样取得良好的效益。                                

(郑颖)


[1] Report of the Fast-track Action Committee on Mapping the Microbiome. http://www.whitehouse.gov/sites/default/files/microsites/ostp/NSTC/ftac-mm_report_final_112015_0.pdf
附件: