美国NSF资助植物基因组研究

作者: 2017-06-30 09:21 来源:
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20161020日,美国国家科学基金会(NSF)宣布投入4400万美元资助植物基因组研究项目(PGRP),以提高农业实践水平,减少对资源的需求,解决环境问题等[1]。该经费除用于支持基因组的植物科学基础问题研究和开发植物基因组研究的工具资源和新技术以外,还有部分经费将用于资助科研人员参与植物基因组领域的职业继续教育,提升新入职人员在职业生涯开始阶段对植物基因组研究的兴趣。

2016年的PGRP项目致力于研究大豆种子繁殖的研究基因调节网络;获得在基因组水平上了解玉米小麦和谷物中维生素含量平衡的种子生物化学原理;发现多年生作物适应气候变化和恢复的能力;利番茄的天然多样性来寻找新的抗病资源;定义长寿树种的表观遗传(基因开关的外部环境因素)变量等。本次获资助的研究项目如下表所示。

1  2016年获资助的NSF植物基因组研究项目

项目名称

负责人

经费/万美元

植物基因组剪接异构体:收集、鉴定和进化关系

W. Brad Barbazuk,佛罗里达大学

46

玉米基因组平衡分析

James Birchler,密苏里哥伦比亚大学

37

自交物种和杂交物种调节模型的发现与评价

Steven Briggs,加利福尼亚大学圣地亚哥分校

139

剖析C4植物中隐含花环结构(Kranz Anatomy)的基因网络

Thomas Brutnell,唐纳德丹佛植物科学中心

166

平衡玉米籽粒中维生素的含量的基因组水平方法

Dean DellaPenna,密歇根州立大学

135

通过生物物理过程建模的非生物压力的生长和产量的基因型变化预测

Brent Ewers,怀俄明大学

280

SECRETome项目:植物细胞的系统评价

Wolf Frommer,华盛顿卡耐基研究所

115

产生大豆种子所需的基因调控网络

Robert Goldberg,加利福尼亚大学洛杉矶分校

204

多年生作物中植物免疫调节基因的发现和功能研究

Mark Guiltinan,宾夕法尼亚州州立大学

208

剖析基因组含量变异的自然机制以及对表型变异的影响

Candice Hirsch,明尼苏达大学双城分校

44

玉米基因组的转录调控

Jay Hollick,俄亥俄州立大学

99

剖析功能冗余的基因组结构,调节分生组织的平衡和作物产量

David Jackson,冷泉港实验室

116

解析与植物伤口木栓质相关的生物合成基因调控网络

Dylan Kosma,内华达大学里诺校区

70

植物如何产生这么多不同的代谢产物:茄科植物基因组学的计算和实验比较研究

Robert Last,密歇根州立大学

278

利用自然变异的番茄的识别、描述和部署新的抗病资源

Gregory Martin,博伊斯汤普森研究植物研究

423

与玉米的生长素信号转导功能域相关的基因组合成方法

Paula McSteen,密苏里堪萨斯大学哥伦比亚

140

适应气候变化的多年生作物:葡萄苗砧木嫁接的传染效应

Allison Miller,圣路易斯大学

239

归化Y染色体在番木瓜基因组机制

Ray Ming,伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校

113

解密在茄科植物中RNA导向的DNA甲基化和繁殖之间的联系

Rebecca Mosher,亚利桑那大学

227

了解玉米的重组

domesticating,康奈尔大学

202

水稻逆境适应系统的基因组学

Michael Purugganan,纽约大学

100

用于植物基因组的分化代谢网络的高通量、高质量注释的计算基础设施

Seung Rhee华盛顿卡耐基研究所

54

玉米的高原适应遗传学

Jeffrey Ross Ibarra,加利福尼亚大学戴维斯分校

176

多年生长寿树木的体细胞遗传和表观遗传变异及其与环境的相互作用

Robert Schmitz,佐治亚大学

106

大米中合子基因组的激活

Venkatesan Sundaresan,加利福尼亚大学戴维斯分校

108

破译控制豆类和谷类植物共生的分子信号途径的一种跨学科方法

Michael Sussman,威斯康星大学麦迪逊分校

181

识别玉米根系结构和植物营养关系控制的遗传基础的整合表型组学方法

Christopher Topp,唐纳德丹佛植物科学中心

144

定义蛋白质SUMO化修饰系统在玉米及其应激保护中的作用

Richard Vierstra,华盛顿大学

93

孤儿基因:驱动进化适应和作物改良的一个尚未开发的遗传库

Eve Wurtele,爱荷华州立大学

107

(郑颖



[1] NSF awards $44 million for genomic research on range of plants, many economically important. https://www.nsf.gov/news/news_summ.jsp?cntn_id=190076&WT.mc_id=USNSF_51&WT.mc_ev=click

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