美国DOE JGI公布2018生物群落科学计划入选项目

作者: 2017-12-07 18:28 来源:
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尽管可以孤立地研究生物体,但是考虑到生物体与环境的相互作用就会出现更复杂的情况。9月下旬,美国能源部联合基因组研究所(JGI)公布了2018年群落科学计划(CSP)入选的30个项目,这些项目的目标是运用多种基因组分析能力和科学专业知识,研究生物能源生成和生物地球化学过程的基础机制[1]。此次批准的CSP 2018项目是从76份项目建议中筛选出来的。

1  2018群落科学计划部分入选研究项目

责任人

责任机构

项目内容

Dan uckley

康奈尔大学

使用稳定同位素探测土壤微生物食物网络,这是一种通过掺入到DNA中的标记底物追踪被消耗营养通量的方法,该方法能用于识别和表征在土壤碳循环中具有关键作用的未培养微生物

Boulos halhoub

法国国家农业研究所

探讨如何通过DNA甲基化和重复杂交形成Brachypodium hybridum的多倍体,这是一种候选生物能源草柳枝稷的亲缘植物。多倍体植物含有多组染色体,可以增加植物耐受能力

Maureen oleman

芝加哥大学

在占地球表面淡水20%的大湖区采用综合生态系统基因组学技术来描绘重要的水生系统中参与营养循环的微生物的代谢多样性和活性

Byron Crump

俄勒冈州立大学

将运用宏基因组学和环境转录组学来研究在河流生态系统中代谢溶解有机物的微生物,这些物质是有机物质从陆地转移到海洋的重要渠道

Alisa Huffaker

加利福尼亚大学圣地亚哥分校

利用JGI在植物、宏基因组和综合计划中的多样化能力,以及代谢组学来分析高粱和玉米代谢多样性系统,以更好地了解微生物群落的相互作用和草本植物如何耐受各种压力

James Leebens-Mack

佐治亚大学

开发一个比较植物基因组学框架,涉及35种物种的高质量基因组组装和注释

Udaya Kalluri

橡树岭国家实验室

研究如何修饰候选生物能源原料作物杨树的细胞壁

Corby Kistler

USDA农业研究所谷物疾病实验室和明尼苏达大学

研究当地草原土壤中细菌和真菌之间的相互拮抗关系,及其制衡系统使多年生植物旺盛生长的机理

Yu Liu

德克萨斯大学西南医学中心

定义丝状真菌粗糙链孢菌Neurospora crassaDNA染色质结构调控网络,该菌种是生物质真菌转化的重要模式生物

Norma Martinez-Gomez

密西根州立大学

鉴定参与植物—微生物相互作用的稀土元素依赖酶,这些酶可用于提高候选生物能源原料作物等的产量,同时减少对化肥的需求

Jennifer Martiny

加州大学欧文分校

研究干旱生态系统中表面土壤微生物对叶片凋落物的活性,了解每日水分和温度的循环如何影响营养循环

Neslihan Tas

劳伦斯伯克利国家实验室

计划在流域生态系统中使用测序和代谢组学分析微生物的功能

Ru Zhang

唐纳德·丹福斯植物科学中心

研究如何利用JGI的测序和组装设备来完成绿藻Chlamydomonas reinhardtii的基因组测序,调整它对日照长度的热应激响应

(郑颖)



[1] 2018 DOE JGI Community Science Program Allocations Announced. https://jgi.doe.gov/2018-jgi-csp-community-science-program-approved-proposals-announced/

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