欧盟启动生物多样性基因组学欧洲项目

作者: 2023-02-20 15:07 来源:
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2022926日,欧盟委员会正式启动生物多样性基因组学欧洲BGE)项目[1],旨在加速利用基因组科学来增强对生物多样性的理解,监测生物多样性变化,并提供指导制定干预措施以解决生物多样性下降问题。该项目获得了来自欧盟委员会、英国和瑞士政府的2100万欧元(约合1.52亿元人民币)资助,汇集了来自生物扫描欧洲BIOSCAN Europe)计划的DNA条形码联机构的104个合伙伴机构和欧洲参考基因组图谱(ERGA)计划的基因组测序联盟的709个成员。

BGE项目将解决3个基本目标:在欧洲一级建立运作良好的生物多样性基因组学网络,以连接和提高社区能力,利用基因组工具应对生物多样性危机;为欧洲建立和实施大规模的生物多样性基因组数据生成管道,以加快用于生物多样性表征、保护和生物监测的基因组数据的生产和获取;应用基因组工具加强对泛欧生物多样性和生物多样性下降的了解,以提高管理干预措施和生物监测计划的效力。BGE项目将集成两个新创建的网络:一个是专注于DNA条形码的BIOSCAN Europe,另一个是专注于欧洲的真核物种基因组测序的ERGA

1DNA条形码和数据归档。DNA条形码是识别和监测物种的关键,BGE可为研究人员提供一种简单而单一的方式来访问这些数据。收集的数据将被统一存储在欧洲生物信息研究所(EMBL-EBI)的欧洲核苷酸档案(ENA)中,研究人员可以自由访问其感兴趣物种的DNA条形码和测序数据。作为ERGA的重要工作,BGE已经开始建立数据归档工作流程,以管理流入ENA的数据流。BGE还将通过开发和支持欧洲条形码数据的基础设施,推进数据提交标准在BIOSCAN Europe 中发挥作用。

2、区域性测序,全球标准。欧洲生物信息研究所的Ensembl团队将利用他们在创建高质量基因组注释和直观数据门户方面所积累的专业知识为BGE项目做出贡献,从而使全球科学家可以公开获取和轻松访问大量BGE数据。Ensembl团队曾通过达尔文生命之树项目对英国和爱尔兰的所有物种进行测序。在BGE中,该团队将扩大这些过程,并推动全球的协调,从而成为地球生物基因组项目的重要组成部分。地球生物基因组项目旨在对所有人类的基因组进行测序、编目和表征地球的真核生物多样性。                           (郑颖)



[1] Biodiversity Genomics Europe: addressing biodiversity loss through genomics. https://www.ebi.ac.uk/about/news/announcements/biodiversity-genomics-europe-addressing-biodiversity-loss-through-genomics/

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