全球生物多样性信息平台更新海洋生物DNA衍生数据发布指南

作者: 2023-11-20 12:05 来源:
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67日,全球生物多样性信息平台(GBIF)更新了《通过生物多样性数据平台发布基因组和宏基因组数据》指南[1]。该指南针对基因组和宏基因组技术信息持有人,包括如何记录基于DNA的世界海洋研究共享的建议。

该指南首次发布于20219月,强调原始基因组数据应首先通过国际核苷酸序列数据库合作组织(INSDC)的三个镜像之一进行共享。然而,数据持有人通过GBIF和海洋生物多样性信息系统(OBIS)维护的生物多样性平台,将非人类生物的DNA衍生证据重现为出现记录,将为世界生物多样性提供了更完整和交叉索引的视图。

该指南的新海洋专题建议,优化与OBIS共享的环境DNAeDNA)数据。OBIS是联合国教科文组织(UNESCO)国际海洋数据和信息交换(IODE)计划的重要组成部分,OBIS.org提供了一个专门处理海洋生物多样性的全球平台,提供关于海洋生物多样性的多样性、分布和丰度等数据和信息。

该指南增加了关于如何发布海洋生物DNA衍生数据的详细信息。持有基因组和宏基因组数据的生物多样性数据持有者可以通过OBISGBIF和其他生物多样性数据库发布优化使用的海洋数据集,从而获得最广泛的受众和影响。遵循指南中针对OBIS的新建议,将确保与世界海洋物种名录(WoRMS)中的分类命名一致、位置和深度坐标的准确性,以及包含描述与生物出现相关的关键属性的附加测量和事实。

在支持可发现、可访问、可交互、可重用(FAIR)和开放数据的生物多样性平台上报告基于DNA的出现记录,可以为数据持有者带来四方面的好处:将分类学和生态学知识应用于保护、气候变化、生态学、人类健康和其他生命科学领域;改善对过去因采样不足和被忽视的生物体的认知,促进它们更好地融入保护和决策应用;提供一个动态机制,以使未描述的分类群的发生记录可供使用,并在其被描述后及时更新;增加数据的引用和重复使用。                             (郑颖)



[1] Updated guide adds details on how to publish DNA-derived data on marine life. https://www.gbif.org/zh/news/2VXK7tpe7wM9J9lghWmxQh/updated-guide-adds-details-on-how-to-publish-dna-derived-data-on-marine-life

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