蛋白质组学研究期待技术革命

作者:张玉奎 2015-07-27 09:41 来源:中国科学报
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  张玉奎

  日前,在第二十届全国色谱学术会议上,中科院院士、中科院大连化物所研究员张玉奎指出,中国的色谱学科队伍已经是世界上最大的,色谱学科论文的数量已有飞跃发展。在蛋白质组学研究中,蛋白质的分离和鉴定依然是目前最基本的任务和目标,“随着蛋白质组学研究的不断深入,蛋白质分离鉴定技术将得到更加广泛的关注”。

  张玉奎指出,我国作为目前世界经济增长速度最快的国家之一,面临着资源、环境、人口与健康、社会可持续发展等诸多挑战,“但同时可以看到,色谱科学和技术,在解决这些重大问题中正发挥越来越重要的作用”。

  色谱是一个具有百年历史的分离分析学科,伴随着社会发展和科学发展的需求,在分离分析新理论、新方法、新技术、新仪器等方面不断创新,色谱队伍不断壮大,英才辈出。

  “近两年来,我国色谱学科在色谱理论研究、多维色谱仪器、新型色谱填料和色谱柱、样品前处理方法、应用领域等方面得到了突飞猛进的发展。”张玉奎进一步指出,当前,色谱的应用领域也在不断扩大,尤其是在与生命科学和环境科学密切相关的代谢组学、蛋白质组学、中药分离分析、环境分析等领域发挥越来越重要的作用。

  他还举例说明了色谱方法在蛋白质组学领域的应用。在2014年,来自约翰斯·霍普金斯大学的蛋白质组研究员Akhilesh Pandey,与来自印度生物信息学研究所等机构的研究人员合作,分析了30种不同的组织类型,标绘了人类蛋白质组的绝大部分。这项研究识别出17294个蛋白编码基因,并通过表达分析证明了组织和细胞特异性蛋白的存在。同年,德国慕尼黑工业大学的Bernhard Küster等人创新性地推出了一个搜索性公共数据库,公布了18097个基因获得的蛋白,占目前预计人类蛋白总数的92%。

  “这两个研究组都利用了质谱方法来分析人类组织。”张玉奎指出,Pandey研究组分析的是全新的数据,针对多种健康人体组织的数据,其中包括7种胎儿组织和6种血细胞类型。而Küster研究组则采用了稍微有些不同的方法,他们汇集了已有质谱分析数据,同时构建了自己的质谱数据。目前,中科院大连化物所近年来也在蛋白组学研究上取得了一系列进展。

  张玉奎最后表示,在蛋白质组学研究中,蛋白质的分离和鉴定依然是目前最基本的任务和目标。随着蛋白质组学研究的不断深入,蛋白质分离鉴定技术将得到更加广泛的关注。

  “新型的高通量、高灵敏多维分离鉴定技术的发展,例如集成化蛋白分析平台,芯片多维液相色谱等,将为蛋白组研究带来新的革命。”张玉奎说。

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